食用菌是可供食用的能形成大型的肉质（或胶质）子实体或菌核组织的高等真菌类。世界上已被描述的真菌达12万余种，能形成大型子实体或菌核组织的达6000余种，可供食用的有2000余种。在自然界中，空气、水、土壤、动植物体内外，以及各种物品上都存在大量的微生物。我们制备食用菌菌种，就是要用有效的方法抑制其他微生物生长，创造有利于山药莲藕清洗机食用菌生长的环境条件，这就需要我们在食用菌生产中对各个环节进行消毒。消毒分为：低温消毒、沸水消毒和化学药剂消毒三种方法。
　　1.低温消毒。低温消毒就是在60-75度的温度下消毒。低温消毒可把大部分微生物的营养细胞杀死，如培养料的发酵过程既是一个低温消毒过程，可以有效杀死生料中的有害杂菌及害虫。
　　2.沸水消毒。沸水消毒就是在沸水中煮沸30-40分钟，以杀死微生物的营养细胞。若要杀死细菌的芽孢或霉菌的孢子，则需延长煮沸时间达2小时以上，主要用于大枣花生清洗机金属接种器具、针筒等的消毒。
　　3.化学药剂消毒。化学药剂消毒是利用化学药物进行杀死微生物的方法。（1）常用于消毒的消毒剂有：用于熏蒸，空气消毒的主要是37%-40%的甲醛原液；用于喷洒地面、墙壁消毒的有：5%的石碳酸溶液、2%-5%的漂白粉溶液、1%-2%的来苏尔、波尔多液（1：1的硫酸铜、石灰稀释配置成100-200倍的溶液）等。注意操作者进入菇房时尽量将甲醛气体排尽。（2）用于接种室、器械、菇木表面等消毒剂：接种时台面、器械、菇木表面、接种人员的手等常用70%-75%的酒精消毒，不可用无水乙醇及95%的乙醇。此外，还可以用5%的甲醛、0.25%新洁尔灭、0.1%的升汞蒸煮机溶液、0.1%-0.2%的高锰酸钾溶液等进行消毒。

     食用菌虽然是可供人们食用的，但在生产加工的过程中也需要科学的消毒，把不好的去掉，对人类身体有益的保留下来。让人们食用起来更健康。